Havuz bakımında en sık yaşanan sorun yosundur. Normal bakım programlarında klor seviyesi düştüğünde, birkaç saat için bile, yosunun üremesi başlar. Yosunla mücadele için birkaç çeşit kimyasallar bulunur. Bunlar: yosun önleyiciler, yosun öldürücüler, mineral sistemler.

Bu kimyasallar haftalık olarak havuza ilave edilir ve yosunun üremesine engel olmaya yardım eder. Tabii ki havuzda klor bulunmadığı sürece tek başlarına yosuna engel olamazlar, ama yeşermesini yavaşlatırlar.

Havuzu yosun tuttuktan sonra bu yosunu öldürmek amacıyla yosun öldürücü kullanılır. Bunlar yine klor ile birlikte etkili olup, tek başlarına yosunun üremesini yavaşlatır.

Henüz memleketimize yaygın olmayan ama yurt dısında rağbet gören, genelde bakır ve gümüş içeren doğal mineral sistemlerde yosuna karşı çok etkilidir. İlk uygulandığında, varolan yosunu kısa sürede çözüp tekrar üremesini tamamen engellerler.

Bunlar ile birlikte, çok daha az klor ihtiyacı duyulan havuzların hem Bakımı hemde kimyasal giderleri çok düşer. Türkiye'ye yeni giren (ama uzun geçmişi olan) Pool Wizard doğal mineraller içeren bir örnektir.

Yosun önleyici ve öldürücü kimyasalların yarattığı sorunlar da bulunmaktadır. Özetle meydana gelebilecek sorunlar şöyledir:

Türkiye'de yosun ilaçları kimyasal konsantreye su ile karıştırılarak piyasaya sunulduğu için konsentrasyonlarda standardı yoktur. Aldığınız ilacın talimatlarını takip ediniz.